资 源 简 介
Diplomová práce: Procházení chemického prostoru na úrovni scaffoldů
Vymyslete a implementujte algoritmus, který bude umožňovat procházení prostoru chemických sloučenin pomocí techniky scaffold hopping, kdy je molekula reprezentována zjednodušenou formou (scaffoldem). Scaffoldy lze definovat s různou úrovní granularity a složitost procházení prostoru je pak dána granularitou scaffoldu. Zadefinujte různé úrovně scaffoldů a na každé z nich implementujte procházení prostoru pomocí morfovacích operátorů (viz. existující algoritmus Molpher). Experimentálně ověřte schopnost nalezení cesty mezi dvojicí molekul v prostoru na různých úrovních granularity.
Plán práce
Zadefinujte úrovně granularity scaffoldů (leden - únor)
Zadefinujte morfovací operátory na jednotlivýc úrovních (únor)
Implementujte procházení prostoru na jedn
